310型基因分析儀
隨着分子生物技術在人類基因組測序、人類遺傳病、傳染病和癌証的臨床診斷、生物工程藥物的篩選、動植物雜交育種、動物親子鑑定和性別鑑定、植物疾病診斷、法醫鑑定等方面的應用,科學工作者越來越需要一種自動化程度更高,應用更廣氾,價格更為適中的遺傳分析儀,為滿足這種需要,美國Applied Biosystems公司于1995年推出了310型全自動遺傳分析儀,310型不僅具有DNA測序、PCR片段大小分析和定量分析功能,而且實現了全部操作自動化,包括自動灌膠、自動進樣、自動數據收集分析。
310型全自動遺傳分析儀採用毛細管電泳技術取代傳統的聚丙烯酰胺凝膠平板電泳進行DNA測序分析,繁鎖的灌膠和上樣過程全部由泵和自動進樣器完成。每次測序之前,只需把樣品放到自動進樣品的樣品盤中,設置電泳參數、數據收集和分析參數即可。Applied Biosystmes公司提供經多年潛心研究的 產品-凝膠高分子聚合物,包括DNA測序膠和GeneScan膠,凝膠顆粒孔徑均一,避免了配膠條件不一致對測序精度的影響。此外,Applied Biosystems公司還提供各種試劑盒,應用軟件和全球性的技術支持。
310型全自動DNA測序儀具有以下特點:
l 應用廣氾
測序及片段分析的應用包括未知序列測定、已知序列的比較測序、雜合子分析(Heterozygote Detection)、SSCP分析(SSCP Analysis)、微衛星序列分析(Microsatellite Analysis)、長片段PCR(分析Long PCR)等
l 自動化程度高
自動灌膠:在分析一個樣品前,泵自動沖掉上一次分析用過的膠,灌入新膠。
自動取樣:把待測樣品放到自動進樣器的樣品盤中,由計算機程序控制自動進樣。自動進樣器有48孔和96孔兩種樣品盤,其中96孔樣品盤與本公司9600型PCR儀的樣品盤一致,所以經PCR循環測序反應的樣品可直接放到310測序儀中測序,此外特殊設計的樣品蓋可防止蒸發。
l 多色熒光毛細管測序技術:
由於採用 四色熒光標記技術,使四個測序反應產物可以在一根毛細管內電泳,使毛細管測序成為可能,同時也大大提高了測序精度,即降低了同位素測序因泳道間遷移率差異對精度的影響。而且與377型遺傳分析儀一樣,310型遺傳分析儀也採用CCD攝像機作為檢測器,使每個樣品分析時間僅為2.5小時。
l 全自動電腦控制:
只需把測序樣品放到自動進器樣品盤中,輸入樣品信息,如:進樣次序、進樣時間和電壓,和數據分析模式,如:SSCP、微衛星序列、VNTRS、DNA序列分析等模式,其餘的工作,如:灌膠、進樣、電泳、檢測、數據分析全部由電腦控制進行。此外電腦還控制電泳的溫度、電壓、時間,同步監測電泳的情況,在分析上一個樣品數據的同時還可以收集下一個樣品的數據。
l 豐富的應用試劑盒及軟件
Applied Biosystems公司提供多種應用試劑盒及應用軟件,如用於親子鑑定和個體識別的 Profiler Plus, Cofiler, SGM plus試劑盒,用於真菌鑑定分型的D2 rRNA測序試劑盒,用於 移植配型分析的HLA基因測序試劑盒,用於細菌鑑定分型的16s rRNA測序試劑盒,用於愛滋病毒突變檢測及新藥研發的HIV Genotyping試劑盒,用於脆性X檢測的Fragile X試劑盒,用於單核苷酸多態性分析的SNapshot試劑盒,用於動植物育種、基因組作圖及差異顯示的AFLP試劑盒等,廣氾應用於人類、動植物、微生物等各項研究領域。
性能指標:
310型遺傳分析儀性能表
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應用舉例
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分離膠
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毛細管
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電泳時間及溫度
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分辨大小
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24小時產率
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標準測序
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DNA測序
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POP-6
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內徑50mm
長度61cm
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2.75 hr
50°C
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600Nt
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5220Nt
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快速測序
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比較測序
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POP-6
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內徑50mm
長度47cm
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60 min
50°C
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400Nt
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9120Nt
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片段大小分析
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微衛星分析
差異顯示AFLPs
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POP-4
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內徑50mm
長度47cm
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30 min
60°C
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350Nt
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720個片段
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VNTRs
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3.0%片段分析膠
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內徑50mm
長度47cm
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21 min
30°C
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350Nt
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204個樣品
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突變檢測
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SSCP
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3.0%片段分析
10%甘油
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內徑50mm
長度47cm
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20 min
30°C
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300Nt
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72個樣品
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定量
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RT-PCR
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3.0%片段
分析膠
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內徑50mm
長度47cm
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22 min
30°C
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1000Nt
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195個樣品
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規格指標:
檢測系統:CCD檢測熒光波長範圍:525-650 nm
光源:氬離子激光光源 激發波長:488nm和4nm 激發功率:10mW
電泳電壓:100V – 15000V
灌膠泵:壓力可高達1,800psi
樣品盤:兩種規格:48孔或96孔
控溫板:毛細管溫度範圍:室溫-60°C
電腦:蘋果G3電腦或同級別電腦
打印機:Epson Stylus Color 900型或850型打印機
儀器尺寸:
電泳系統:寬度—60.96cm 高度—86.36cm 深度—55.88cm 重量—94.5kg
電腦系統:寬度—35.5cm 高度—45.5cm 深度—43.0cm 重量—27.50kg
打印機:寬度—46.75cm 高度—32.50cm 深度29.60cm 重量—8.33kg